Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Frmpd1A2AKB4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Frmpd1A2AKB4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Frmpd1A2AKB4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms