Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ambra1A2AH22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ambra1A2AH22 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms