Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl2A2AGA4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhbdl2A2AGA4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms