Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms