Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms