Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms