Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms