Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm14470-201ENSMUST00000119085 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm14514-201ENSMUST00000121680 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm36976-201ENSMUST00000192632 1110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Aqp9-201ENSMUST00000060917 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Aqp9-202ENSMUST00000074465 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cd209c-201ENSMUST00000044060 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Pfkfb2-201ENSMUST00000050406 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm24105-201ENSMUST00000174933 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm22461-201ENSMUST00000175272 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm8435-201ENSMUST00000219481 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ofcc1-202ENSMUST00000224813 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Nrf1-202ENSMUST00000069808 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ubash3b-206ENSMUST00000151485 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Fam169a-201ENSMUST00000042517 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm4772-201ENSMUST00000122221 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm26963-201ENSMUST00000183172 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 4930433I11Rik-201ENSMUST00000171664 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Papolg-202ENSMUST00000102863 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 4933402D24Rik-201ENSMUST00000027102 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm15470-201ENSMUST00000119135 1371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Rab2b-203ENSMUST00000167116 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Wfdc11-201ENSMUST00000109332 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm7609-202ENSMUST00000113407 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 4931406B18Rik-202ENSMUST00000163474 726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm9568-201ENSMUST00000182514 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2bQ01097 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms