Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Smok4a-202ENSMUST00000144015 2317 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm20394-201ENSMUST00000173304 942 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Btnl5-ps-201ENSMUST00000097346 1751 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 St7-201ENSMUST00000000674 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cald1-204ENSMUST00000115026 4080 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm16239-201ENSMUST00000160182 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Vpreb1P13372 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms