Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Ccdc190-202ENSMUST00000175731 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 1700029F12Rik-201ENSMUST00000091377 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm7125-201ENSMUST00000093430 273 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Isx-201ENSMUST00000034034 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb1P09055 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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