Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Cul4b-201ENSMUST00000016681 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Pdcl-201ENSMUST00000009174 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm12741-201ENSMUST00000118836 556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Mitf-207ENSMUST00000203884 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Nup107-201ENSMUST00000064848 3114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gp1ba-201ENSMUST00000055184 2710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Stx16-202ENSMUST00000087908 3865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Zcchc12-204ENSMUST00000115258 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Aftph-209ENSMUST00000177543 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Rc3h2-203ENSMUST00000112936 5828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Fgf9-203ENSMUST00000165526 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Spire1-207ENSMUST00000224799 2059 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q8BGC1 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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