Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Epb42P49222 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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