Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pcx-201ENSMUST00000068004 4148 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Aldoc-201ENSMUST00000017534 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Thsd1-203ENSMUST00000162447 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sh3bgrl2-204ENSMUST00000188241 3155 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Styk1-201ENSMUST00000049150 3380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms