Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3238W4VSP7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3238W4VSP7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms