Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms