Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm4T1NXB5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vstm4T1NXB5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms