Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Robo3Q9Z2I4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms