Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd4Q9Z2D7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms