Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip6Q9Z1Y4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms