Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms