Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgr5Q9Z1P4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms