Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfrp4Q9Z1N6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms