Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr4Q9Z1L2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr4Q9Z1L2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms