Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Padi3Q9Z184 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Padi3Q9Z184 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Padi3Q9Z184 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms