Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo3Q9Z172 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms