Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms