Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clip2Q9Z0H8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clip2Q9Z0H8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms