Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms