Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stxbp4Q9WV89 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stxbp4Q9WV89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms