Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec2Q9WV35 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms