Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ArcQ9WV31 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms