Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1a4Q9WV27 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms