Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opn3Q9WUK7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms