Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mixl1Q9WUI0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms