Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdcd6ipQ9WU78 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd6ipQ9WU78 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms