Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms