Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lemd3Q9WU40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lemd3Q9WU40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms