Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggps1Q9WTN0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggps1Q9WTN0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms