Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam50bQ9WTJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam50bQ9WTJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms