Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc2Q9R244 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms