Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TapbpQ9R233 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TapbpQ9R233 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms