Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc6Q9R1S7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc6Q9R1S7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms