Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntn3Q9R1A3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntn3Q9R1A3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms