Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra1Q9R118 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms