Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clec4eQ9R0Q8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Clec4eQ9R0Q8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4eQ9R0Q8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms