Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod1Q9R0E2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.2 ms