Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Wdr54Q9R0D8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms