Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek3Q9R0A5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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