Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf4Q9QZS2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf4Q9QZS2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf4Q9QZS2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms