Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp21Q9QZL6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp21Q9QZL6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms